A partir de 2001 a OJM torna-se na primeira orquestra de jazz nacional a encomendar obras a compositores portugueses. Essa ideia culmina com o concerto de encerramento da Porto 2001 na área do jazz, onde a OJM, dirigida por Zé Eduardo, interpretou obras de: António Pinho Vargas, António Pinto, Bernardo Sasseti, Carlos Azevedo, Laurent Filipe, Mário Laginha, Pedro Moreira e Zé Eduardo. Nesta ocasião participaram como músicos convidados três solistas de prestígio mundial: Bob Berg, Ingrid Jensen e Conrad Herwig. Desde então, a OJM passa a ter, a par do seu repertório de autor, a vontade de se tornar numa orquestra versátil com capacidade para interpretar outros programas.

Em 2002, a maturidade e o nível da orquestra são reforçados através da parceria com o prestigiado Remix Ensemble num concerto em que é interpretado a música do célebre disco da dupla Miles Davis/Gil Evans “Sketches of Spain” dirigida pelo maestro Stephan Ashbury.

Durante 2003 a OJM com o apoio do IA/IPAE e da Casa da Música, convida a prestigiada e histórica compositora Carla Bley para dirigir a sua música no grande auditório da Casa da Música, integrado numa iniciativa chamada de “Festival em Obra Aberta”. Neste concerto a OJM viu-se reforçada com a presença de Steve Swalow e Gary Valente.

A actividade musical da orquestra tem continuado desde então com inúmeros concertos não só em Portugal mas também na vizinha Espanha. Em 2004 o seu repertório original é mais uma vez renovado, convidando dois dos melhores saxofonistas de jazz da actualidade: Mark Turner no Teatro Rivoli e Festival de Jazz de Guimarães; Rich Perry no CCB e no Teatro de Vila Real.